大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了 4 种核苷酸,简记作 A, C, G, T
。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。
在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。
两个基因的相似度的计算方法如下:
对于两个已知基因,例如 AGTGATG
和 GTTAG
,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基 -
,例如:
这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:
那么相似度就是:(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:
相似度为:(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。
共两行。每行首先是一个整数 n,表示基因序列的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含 \verb!A!,\verb!C!,\verb!G!,\verb!T! 四种字母。1 \le n\le 100。
仅一行,即输入基因的相似度。
7 AGTGATG 5 GTTAG
14
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